高温久煮
牛奶是一种热敏性物质，温度达到60℃～62℃时，牛奶中的蛋白质微粒就会脱水，变为凝胶状态，随之出现沉淀，同时牛奶中极不稳定的酸性磷酸钙也会变为中性磷酸钙形成沉淀。
若加热温度达到100℃左右，牛奶中的乳糖会开始焦化呈现褐色，并逐渐分解产生乳酸及少量甲醛。高温久煮，牛奶中的维生素损失也很多。因此，煮牛奶只需加热到刚烧沸就离火，不宜久煮。
加糖同煮
牛奶中的赖氨酸与糖在高温下会发生一种叫梅拉德的化学反应，生成一种有毒物质——果糖基赖氨酸，危害人体健康，而且对儿童危害更大。想饮甜牛奶，应在煮后待牛奶稍凉再加糖。同样，牛奶也不可同巧克力同煮，因为巧克力含有丰富的草酸，同煮同食，牛奶中的钙和草酸会结合成草酸钙而不易被吸收。还会引起腹泻等症状。因此，二者宜分开食用。
空腹喝奶
空腹时胃肠蠕动较快，牛奶在胃肠停留时间短，不能与消化酶充分接触，其营养物质还未来得及消化就“匆忙”排入大肠，不能被充分吸收利用。正确的饮用方法是同时加食馒头、面包、糕点等淀粉类食品，使牛奶中的蛋白质、钙等营养物质在淀粉的作用下在胃肠停留时间延长，营养物质被充分吸收利用。
与酸混食
牛奶进入胃肠后，先由胃液中的胃蛋白酶及胰蛋白酶与牛奶中的蛋白质结合，然后进入小肠。此时若吃进酸性饮料或水果，会使牛奶中的蛋白质与果酸及维生素C凝结成块，不仅会影响消化吸收，还会出现腹泻、腹痛、腹胀等症状。
保存不当
有的人在夏季喜欢冰镇(冰冻)牛奶。当牛奶冰镇温度低于零摄氏度时，其中的脂肪、蛋白质分离，酪蛋白呈粉状凝结，味道就会明显减弱，营养成分不易被吸收。人若是常饮冰镇牛奶，还容易促使胃肠道疾病如溃疡病、胆囊炎、肠炎等的复发。还有人喜欢将一次喝不完的牛奶放在保温瓶里暂存，这样做，牛奶中的细菌或保温瓶上部空气中的细菌就像进入一个有营养的温箱里，大量繁殖，几个小时就会使牛奶酸败变质，其中维生素B和C也都会大量丢失。因此，煮好的牛奶应待稍凉后即时饮用最好。