1.新鲜牛奶脱脂，加酸（乳酸、乙酸、盐酸或硫酸），将pH调至4.6，使干酪素微胶粒失去电荷而凝固沉淀。用这种方法得到的干酪素称为酸酪蛋白，加酸的种类不同得到的酸酪蛋白却几乎毫无区别。酸酪蛋白是白色至淡黄色粉末或颗粒，稍有奶臭和酸味。在水中只是溶胀，若加入氨；碱及其盐时，则可分散溶解于水中。可溶于强酸；二乙醇胺；吗啉；尿素；甲酰胺；热苯酚和土耳其红油。
2.将牛奶与粗制凝乳酶作用，形成凝固沉淀物，称为粗制凝乳酶酪蛋白，呈白色粒状，几乎无味无臭，加热灼烧会产生特有的臭味。凝乳酶酪蛋白比酸酪蛋白的灰分含量高。